蛋白酶是一类执行蛋白质水解功能的酶，通过水解连接氨基酸的肽键将蛋白质消化或裂解成更小的肽或氨基酸，是体内催化蛋白水解反应的关键酶。大多数蛋白酶已经进化到通过许多不同的机制来执行这些反应，并在动物、植物、细菌、古细菌和病毒中均有发现。蛋白酶参与蛋白质加工、蛋白质功能调节、细胞凋亡、病毒致病、消化等许多重要过程。

蛋白酶表现出显著的底物特异性，这意味着它们可以选择性地靶向和切割蛋白质分子内的特定肽键。这种特异性是由每种蛋白酶活性位点的独特结构决定的，这使其能够识别和结合特定的氨基酸序列。

在药物发现中靶向蛋白酶使我们能够调节特定的途径和细胞功能。开发蛋白酶抑制剂可以帮助调节异常的蛋白酶活性，预防疾病进展，促进健康。