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在激活受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine kinase, RTK)等受体的外部刺激(如生长因子)下,RAS GTPase将信号转导传递至丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)/细胞外信号调节激酶(intercell-signal-regulated kinase, ERK)级联反应。构成 MAPK/ERK 信号转导的三层激酶级联反应是研究最充分的致癌信号通路之一,信号转导级联的分层组成包括MAPKKK(例如BRAF)、MAPKK(如MEK)和MAPK(如ERK1/2)。该信号通路的激活导致广泛的效应子事件,导致转录重新布线和细胞生长信号转导。重要的是,在正常情况下,ERK信号转导的一系列负调节因子是ERK输出的直接下游目标;这种负反馈环路确保了通路信号转导的持续时间和幅度适合正常生理状态。
在哺乳动物细胞中,有三种 RAF 蛋白,即ARAF、BRAF和CRAF(也称为 RAF1)。RAF 家族成员由三个保守结构域组成——分别为保守区域 CR1、CR2、CR3。CR1是RAS GTP结合的自我调节结构域,CR2是富含丝氨酸的铰链区,CR3是催化丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域,可磷酸化蛋白质底物上的共有序列。尽管所有三种 RAF 激酶在正常生理学中都起着重要作用,但 BRAF 是主要的 RAF 激酶,在许多不同的癌症类型中发生改变;例如,近60%的黑色素瘤、60%的甲状腺癌、15%的结直肠癌和5%-8%的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)显示BRAF突变。BRAF(而不是其他 RAF)作为致癌基因的生物学特异性尚不完全清楚。可能的解释是,与CRAF和ARAF相比,BRAF的组织特异性调控或表达水平或激活MEK的能力可能更广泛地发挥“管家”基因的作用。
突变的BRAF是多种组织起源癌症中的主要驱动基因改变。据报道,近60%的黑色素瘤为BRAF突变,该基因突变也存在于结直肠癌、甲状腺状癌、非小细胞肺癌以及胶质母细胞瘤等疾病中。由于BRAF是RAS信号网络的近端调控成分,并且MAPK通路激活是肿瘤细胞中真正的致癌特征,因此BRAF失活可以解决多种MAPK通路驱动的癌症。然而,现在人们认识到BRAF活性调控的机制比预期的要复杂得多。例如,越来越多的证据表明,正常细胞中RAS依赖性RAF 激酶激活需要RAF二聚化。在这种情况下,尽管BRAF可以与任何RAF家族成员发生二聚化,但BRAF-CRAF异二聚体被认为占主导地位。在癌症中,观察到功能失调的调节:(1)突变的BRAF通常可以执行独立于RAS的信号转导功能;(2)V600突变的BRAF蛋白可以作为单体进行下游信号转导;(3)RAF蛋白可以同源二聚化。基于这些原理,在RAS突变肿瘤中,BRAF失活后,MAPK信号转导的反常激活可能发生。
激酶常规检测通过梯度稀释化合物确定不同浓度下药物的抑制率,但单个靶点的筛选不能保证脱靶效应(科学家们一直期望药物仅作用于疾病治疗相关的靶点,而不与药物设计之外的靶点产生作用即脱靶效应)。激酶谱筛选通过多个靶点对化合物单浓度进行检测,更直观的显示出药物对哪些靶点有效,也在制药初期较好的控制脱靶效应。
除了保证体外实验的准确性,也得确保化合物在人体内的作用效果, 随着对靶点治疗的深入了解,也应该逐步提高体外安全性和激酶选择性,同时防止脱靶效应。
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