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PROTAC分子的血浆蛋白结合，结果可用于基于血浆游离药物浓度的PK/PD分析。常用的三种方式包含平衡透析法，超滤法和超速离心法。由于PROTAC分子的非特异性吸附，更适用于超速离心法。通过优化离心的转速和时间，测试超速离心后中间水层的药物浓度与离心前血浆中的药物浓度对比，计算游离率。PROTAC分子一般和血浆蛋白有较强的结合，所以游离率会较低，通常<1%，这对分析的准确度要求较高，也可采用稀释过后的血浆和预先饱和两种方式结合，且增加孵育时间，满足溶解度的条件下提高孵育浓度等方法，获得较为准确的数据。下表是我们对PROTAC分子ARV-771采用两种方式进行人血浆蛋白结合测试的结果，可以看出超离法与文献中的数据是比较吻合的。
由于高蛋白结合的特性，对于PTOTAC分子体外细胞活性测试体系，最好采用游离药物浓度来对数据进行校正。
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